Ce parc, d'une superficie de 5,8 km², est divisé en deux secteurs : l'île Bonaventure et le rocher Percé. Les sentiers arpentent le secteur de l'île Bonaventure. En les parcourant, on passera par différents milieux naturels : prairie, friche, forêts mixte et boréale, tourbière, plage, falaise et une zone de mousses et de lichens. L'île compte plus de 500 espèces végétales dont des plantes arctiques-alpines. Les sentiers mènent tous à une colonie de fous de bassan, la plus importante en Amérique du Nord. Des panneaux d'interprétation traitent de cet oiseau. On verra aussi un groupement d'environ 250 000 oiseaux de milieu marin comme les guillemots et les petits pingouins. Près de là, une tour d'observation permet d'apercevoir des baleines au large. Le sentier Chemin-du-Roy longe la falaise, passe par la baie des Marigots et permet d'admirer les maisons ancestrales et le paysage. Sur le littoral, on pourra apercevoir des crabes et des étoiles de mer ou encore, au loin, des phoques et des dauphins.